根据一级客运站的标准建设，占地面积126亩的新西客站总体布局采取功能分区设计，主站房为旅客服务与现场作业区，办公管理用房为后勤保障区。

　　主站房建设风格为宽敞明亮、科学美观的车站大厅，底层为短途候车大厅和售票处，内部4层收缩为凌空夹层式，二层为重点旅客候车厅和行李转运区，三层为车站办公室，四层为设备房。办公管理用房设计力求突出福州西大门城市形象，以临街高层作为标致性建筑，实现整体建筑群在大学新区中形成特色，目前已投入试运营，将成为福州大学城一个重要的交通集聚枢纽。